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分别为10属、结构5属和5属
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简介在属水平上,将相对丰度排名前30位的属进行聚类分析,绘制成热图(图4),结果显示相对丰度排名前30位的细菌来源于变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌 ...
在属水平上,百香将相对丰度排名前30位的果连属进行聚类分析,绘制成热图(图4),作对结果显示相对丰度排名前30位的土壤细菌来源于变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、细菌响放线菌门(Actinobacteria)、群落浮霉菌门 (Planctomycetes)、结构绿弯菌门(Chloroflexi)、百香WPS-2、果连己科河菌门(Rokubacteria)、作对厚壁菌门(Firmicutes)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)等9个门类,土壤其中变形菌门、细菌响酸杆菌门和放线菌门占前30属中的群落66.7%,分别为10属、结构5属和5属。百香
所有样本中,相对丰度大于1%的属有24属,相对丰度占58.51%,其中相对丰度最高的10属占总丰度的40.68%,依次分别为酸杆菌门Subgroup_2目下的未定名属(占8.57%)、变形菌门根瘤菌目的未定名属(占5.12%)、酸杆菌目未定名属(占4.81%)、热酸菌属(Acidothermus,占4.38%)、Elsterales目未定名属(占3.52%)、出芽菌科(Gemmataceae)未定名属(占2.78%)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium, 占2.71%)、Candidatus Solibacter(占2.43%)、水球菌属(Aquisphaera, 占2.16%)、酸杆菌门Subgroup_6纲下未定名属(占2.11%)、变形菌门Acidibacter属(占2.09%)。
方差分析表明,不同连作年限土壤细菌间,前30属的相对丰度差异显著(P<0.05),其中酸杆菌门Subgroup_2目下的未定名属、Aquisphaera、Acidibacter、Bryobacter、分枝杆菌属(Mycobacterium)等属的丰度随连作年限的增加而显著降低,而芽孢杆菌属(Bacillus)、酸杆菌门Subgroup_6纲下未定名属等属丰度随连作年限增加而显著增大。
2.3.2 不同连作年限土壤细菌群落结构
为了进一步对细菌群落物种组成差异进行分析,探讨不同连作年限间群落细菌组成的相似性或差异性,基于Bray-Curtis距离算法,采用主坐标分析(PCoA)对不同连作年限土壤细菌群落差异进行分析,结果如图5所示,在OUT水平上,PC1 与 PC2 分别解释方差为54.96%和17.02%,累计解释能力达71.98%,不同连作年限间土壤细菌群落差异显著(P=0.001,R=1),撂荒地土壤样本与百香果种植地样本在第一主成分上很好地被区分,种植第一年(TF)与种植第二年(TS)土壤细菌群落组成较相近;每个处理的三个重复样本的聚集性较好,显示出较好的重复性,第一年种植的土壤细菌组内差异较大。同时,采用Bray-Curtis算法对15个土壤样本细菌群落进行样本层级聚类分析,结果表明(如图6):15个土壤样本明显聚集为5组,与5个连作年限对应,其中连作3年的样本(TT)单独为一簇,与其他4个样本分开;第一年种植(TF)和第二年种植(TS)的样本与撂荒地(TZ)的相似距离较近,说明百香果连作显著影响土壤细菌群落结构。
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相关链接:细菌,根瘤菌,样本
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